พิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ สุรินทร์ เป็นหน่วยงานหนึ่งในสังกัดสำนักงานโบราณคดีและพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติที่ 9 นครราชสีมา มีฐานะเทียบเท่ากับระดับฝ่าย โดยแบ่งโครงสร้างขององค์กร ดังนี้
หัวหน้าพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ สุรินทร์
- ฝ่ายวิชาการและคลังพิพิธภัณฑ์
- ฝ่ายพัสดุและรักษาความปลอดภัย
- ฝ่ายบริหารและธุรการ
โดยมีอัตรากำลัง ดังนี้
ข้าราชการ
1. หัวหน้าพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ สุรินทร์ ภัณฑารักษ์ ระดับ 6 
2. ภัณฑารักษ์ ระดับ 3 - 5 
3. เจ้าหน้าที่พิพิธภัณฑ์ ระดับ 4 
4. เจ้าหน้าที่พิพิธภัณฑ์ ระดับ 1 - 3 

จำนวน 1 อัตรา
จำนวน 1 อัตรา
จำนวน 1 อัตรา
จำนวน 1 อัตรา
ลูกจ้างประจำ
1. นักการภารโรง 

จำนวน 1 อัตรา
ลูกจ้างชั่วคราว
1. นักวิชาการวัฒนธรรม 
2. ยามรักษาการณ์ 

จำนวน 1 อัตรา
จำนวน 2 อัตรา

รวมทั้งสิ้น 

จำนวน 8 อัตรา