ผังห้องจัดแสดงชั้นล่าง
ห้องที่ 1 ห้องข้อมูลข่าวสาร
ห้องที่ 2 ห้องภูมิหลังเมืองสตูล
ห้องที่ 3 ห้องประชาสัมพันธ์
ห้องที่ 4 ห้องวิถีชีวิตชาวสตูล
ห้องที่ 5 ห้องจัดแสดงนิทรรศการชั่วคราว

ผังห้องจัดแสดงชั้นบน
ห้องที่ 6 ห้องบ้านเจ้าเมือง
ห้องที่ 7 ห้องเรือนชานชาวบ้านสตูล
ห้องที่ 8 ห้องรับแขกร่วมสมัยกูเด็น
ห้องที่ 9 ห้องวัฒนธรรมชาวไทย-มุสลิมในสตูล
ห้องที่ 10 ส่วนชั้นดาดฟ้าและ Cafeteria