การจัดแสดงแบ่งเป็นห้องดังนี้


      
1.       ห้องภูมิหลังกาญจนบุรี        




        

       2.       ห้องโบราณคดีบ้านเก่า     

       3.       ห้องจัดแสดงโลงศพโบราณ        

       4.       ห้องแหล่งโบราณคดีกาญจนบุรี        

        5.       ห้องพัฒนาการชุมชน   


            พิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ บ้านเก่า  ได้จัดแสดงเรื่องราวและโบราณวัตถุจากแหล่งโบราณคดีบ้านเก่า  ประกอบด้วยเครื่องปั้นดินเผา  เครื่องมือหิน เครื่องประดับ โครงกระดูก อายุประมาณ 3,600 ปีมาแล้ว  และจัดแสดงโบราณวัตถุสมัยก่อนประวัติศาสตร์จากแหล่งโบราณคดีที่สำคัญตามลำน้ำแควน้อยและแควใหญ่  จังหวัดกาญจนบุรี   และจัดแสดงโลงศพไม้โบราณที่พบในจังหวัดกาญจนบุรี