พระที่นั่งปาฏิหารย์ทัศไนย พระบาทสมเด็จพระมงกุฏเกล้าเจ้าอยู่หัว รัชกาลที่ 6 โปรดฯ ให้สร้างขึ้นเพื่อทรงใช้เป็นที่ประทับทอดพระเนตรพระปฐมเจดีย์ หลังจากทอดพระเนตรปาฏิหารย์แห่งองค์พระปฐมเจดีย์ เมื่อ พ.ศ. 2452 และพ.ศ. 2457 เดิมตั้งอยู่บนชานชาลาชั้นบนระหว่างพระที่นั่งพิมานปฐมกับพระที่นั่งวัชรีรมยา ในพระราชวังสนามจันทร์ จังหวัดนครปฐม ในปี พ.ศ. 2470 รัชสมัยพระบาทสมเด็จพระปกเกล้าเจ้าอยู่หัว รัชกาลที่ 7 จึงย้ายมาปลูกไว้บนชานชาลาหน้าพระที่นั่งพุทไธสวรรย์ พิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ พระนคร ต่อมาย้ายลงมาปลูกไว้ที่ข้างพระที่นั่งอิศราวินิจฉัยด้านเหนือ เมื่อ พ.ศ. 2525